脂肪酸氧化的主要方式為β氧化：①脂肪酸活化生成脂酰CoA；②脂酰CoA在線粒體膜的肉堿脂酰轉移酶Ⅰ(CATaseⅠ)、轉位酶及CATaseⅡ作用下，以肉堿為載體，由胞漿進入線粒體；③在線粒體基質中，脂酰CoA在脂肪酸β氧化多酶復合體的催化下，從脂?；摩?碳原子開始，經過脫氫(輔酶為FAD)、加水、再脫氫(輔酶為NAD⁺)、硫解四步連續(xù)反應，生成1分子乙酰CoA及比原來少兩個碳原子的脂酰CoA。后者再進入β氧化重復上述過程，最終含偶數(shù)碳原子的脂肪酸全部產生乙酰CoA。乙酰CoA可通過三羧酸循環(huán)和電子傳遞鏈徹底氧化，以ATP形式供能；或在肝臟縮合成酮體而被肝外組織氧化利用。1mol軟脂酸進行β氧化需經7次循環(huán)，產生8mol乙酰CoA，最終徹底氧化產生：7×2+7×3+8×12=131molATP，最終凈生成129molATP。